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如果在铁路12306注册时，发现手机号已经被注册过，可以采取以下几种方法解决。
1、确认手机号码是否确实已被注册：有时可能由于输入错误或其他原因误判，建议再次确认手机号码是否真的是被注册了。
2、使用找回密码功能：如果确认手机号码已经被注册过，可以尝试使用找回密码功能，看看能否找回该账号，如果能找回，则可以直接使用原有账号进行登录。
3、联系客服：如果无法找回账号或者确认不是自己之前注册的账号，可以联系铁路客服，寻求他们的帮助，他们可能需要你提供手机号码、身份证等验证信息来确认你的身份，然后协助你解决问题。
4、尝试重新注册：如果确定手机号码是被别人误用或者忘记注销的情况下，可以联系相关平台要求注销原有账号，或者尝试用该手机号重新注册一个账号，不过在重新注册时，可能需要提供客服要求的验证信息来证明该手机号是你的。
无论采取哪种方式，确保提供的信息准确无误，以便顺利解决问题，也要注意个人信息的安全性，避免泄露给他人。